如果印染废水不经处理排入水中，会使水变色、变臭，降低水的透明度。废水中的大量有机物会迅速消耗水中的溶解氧；此外，废水中的悬浮物会在接收水区沉积、厌氧腐化，进一步消耗水中的溶解氧，影响水生动物的生存。常用的治疗方法有：
对合成纤维和75%以上的合成纤维织物采用干印工艺，可消除印染废水。另外，用硝酸钠或过氧化氢代替重铬酸钾作为氧化剂，可有效消除废水中的有害物质。
废水和材料的回收①根据水质特点，对印染废水进行回收利用。例如漂白煮沸废水和染色印花废水应分流，前者可对流洗涤，一水多用，减少排水。②碱回收利用。淡碱液在丝光工艺中可回收利用，也可用于烧制，烧制废碱液用于退浆，重复使用多次。如果碱液量大，可以用三效蒸发回收碱，如果碱液量小，可以用薄膜蒸发器回收碱。③染料回收。石林染料可酸化为隐色酸，呈胶体颗粒，悬浮在残液中，沉淀过滤后回收利用。硫化染料可在反应锅中酸化，释放硫化氢，经沉淀过滤后再利用。另外，超过滤法可以回收还原染料和分散染料。污水色度减少85%，硫化物减少90%。
无害化处理有下面几种方法：
①物理法。有自然沉淀法、吸附法等。印染废水中的悬浮物多为有机物，比例与水相似。粒径一般不大于10微米，沉降速度很慢。自然沉淀可以去除粗粒沉淀物，然后用絮凝剂沉淀。废水中溶解的污染物和脱色主要采用吸附法。吸附剂包括活性炭、活性硅藻土、粉煤灰等。采用较多的是粒状活性炭。活性炭吸附法一般采用预处理设施，去除废水中的悬浮物、聚合物污染物（如浆液、表面活性剂、蛋白质、油）等物质，以免污染活性炭，降低其吸附能力。
②化学处理方法。有中和法、混凝法和氧化法。中和法是调节废水的pH值，降低废水的色度，使废水中的一些溶解染料成为易沉淀的物质，从而提高生物处理效果。混凝法是通过添加混凝剂来去除分散的染料和胶体物质，可以降低90%的色度。COD50～70%。氧化法可分为曝气氧化法和氧化剂氧化法。曝气氧化法是将空气直接进入废水罐，使硫化染料和还原染料沉淀到废水中的还原物质中。这种方法一般不单独使用，而是作为需氧生物处理和混凝处理的预处理。氧化剂氧化法是利用氯、次氯酸盐、臭氧、过氧化氢等氧化剂去除废水中的染料，减少废水中的污染BOD和COD值。近年来，臭氧作为氧化剂的使用效果较好。臭氧具有很强的氧化能力，能有效破坏某些染料的发色基团，使废水变色，并能在不增加污泥量的情况下氧化降解一些难生物降解的有机化合物。
③生物处理法。采用活性污泥法的完全混合型较多。生物转盘、生物转筒、生物接触氧化池和氧化沟也可以使用。可以去除生物法BOD85~90%(见废水生物处理法)
为了提高出水水质，满足排放标准或回用要求，通常需要采用各种方法。