近年来，随着经济的发展，工业废水和生活污水的排放量大大增加，造成了环境污染。由于水质恶化，养殖池塘死鱼事故时有发生；大规模高密度集约养殖，水中微生物大量，疾病越来越多，而鱼类药物滥用容易对鱼类及其消费者造成药物伤害和药物残留。水产养殖与水密切相关，水资源的限制制约着水产养殖的发展。因此，水产养殖废水处理设备的再利用已成为内陆渔业可持续发展的研究热点和关键技术。
物理方法
根据水体的物理化学性质和水体中的污染物，采用曝气、过滤、沉淀、吸附、气浮等方法净化水质。
1.曝气
向水体中添加氧气，去除氨气和氯气等有害气体。一般有两种方法：一种是静置48小时，另一种是机械搅拌水（如叶轮式曝气器）。如果你用自来水养鱼，你应该先让它静置一段时间，让有害气体（如Cl2）逸出。充氧功能可以使池水的上、下水层对流，增加溶解氧，同时使水中的有毒气体逸出，起到改善水质的作用。通常，叶轮式曝气器用于池塘养鱼，而水轮式曝气器主要用于鳗鱼池塘。这是一种机械氧合方法。水质改良剂用于翻转池塘底部的淤泥，搅动池塘水体，使水上下循环。特别是在夏季阳光充足的中午，浮游植物光合作用释放大量氧气，上层水体被溶解氧饱和。水体的有序翻转使整个池塘水体获得了充足的溶解氧。
2.过滤
过滤的目的是去除水中的固体废物、悬浮固体和大型水生生物。常见的过滤器包括：机械过滤器、压力过滤器、砂过滤器等。
3.沉淀
水中的悬浮物容易吸附在鱼鳃上，阻碍了它们的呼吸，增加了水体的浊度和粘度，对鱼苗的孵化不利。因此，通常先设置储水箱进行沉淀处理。
4.吸附
多孔固体物质，如活性炭、硅胶、浮石粉等，可以吸附水中的有毒物质（如氨氮）。高分子重金属吸附剂对水中重金属离子的吸附是目前正在研究的一项新的水净化技术。吸附剂的粒径为0.3-1.2mm，用于吸附水体中的Cu2+、Zn2+、Pb2+和Cd2+，不会对水体造成二次污染。
5.泡沫分离技术
呼吸到水中。水中的表面活性剂被微小的气泡吸收，浮在水面上形成泡沫，可以去除水中溶解和悬浮的物质。然而，这项技术不适用于淡水，只能用于盐度大于5‰的微咸水和海水。基于该原理设计的泡沫浮选分离器已在市场上销售。
6.磁选法
利用电磁原理分离水中重金属离子和其他污染物是目前一种新的水处理方法。