在畜禽养殖全过程中，为了更好地预防禽畜的窦汇区病症，经常在精饲料中加上抗菌药和其它药品，这种药品随精饲料进到动物消化系统后，短期内内进到动物血液循环系统，最后绝大部分的药品经肾脏功能过虑随小便排除身体之外，仅有非常少一部分的药品和抗菌药残余在动物身体内。很多研究表明，大部分饲料抗菌药都是有残余，仅仅残余量尺寸不一样。伴随着科学技术水准的不断提升，大家发觉抗菌素做为饲料添加物应用，对饲养环境已导致了明显的消极不良影响。最先，使禽畜身体内的耐药性病原菌或基因变异病原菌持续出现并持续向环境中排出；次之，禽畜持续向环境中代谢这种抗菌素或其新陈代谢物质，使环境中的耐药性病原菌与基因变异病原菌持续造成。这二者相反又刺激性经营者提升服药使用量、升级药品种类，这就导致了“药品环境污染环境→耐药性或基因变异病原菌造成→增加服药使用量→环境被进一步环境污染”的恶循环。此外，禽畜商品中药品残余进到环境后，很有可能转换为环境生长激素或环境激素的磷酸激酶物，进而立即毁坏生物的多样性并危害人们的身心健康。
针对家禽饲养残余饲料可以采用纯天然好氧解决法来进行解决。纯天然好氧解决法关键依靠土壤层、纯天然水质中的微生物菌种完成净化处理废水的目地，在其中人工湿地净化处理、氧化塘等非常常见。一般来说，正确引导软体沼气池排出的废水到氧化塘中，并维持一段时间完成有机化合物的溶解。一般在氧化塘中栽种姜花、芦苇叶、水葫芦等，其能慢慢溶解废水中的有机化合物，特别是在在绿色植物溶解、化学作用下可完成合理溶解水里的磷、氮等化学物质。经加工处理后的废水可同时用来浇灌田地、山林，进一步提高畜禽养殖废水使用率。
此外也可运用人工湿地完成畜禽养殖废水的解决。当畜禽养殖废水引进至人工湿地后，栽种在湿地公园中植物的茎、根等便会阻拦大颗粒状的有机化合物。与此同时，在绿色植物根茎有氧呼吸危害下，O2会融解到废水中，给好氧菌的发育繁育给予良好条件，很多生長繁育的好氧菌会溶解和消化吸收废水中的有机化合物。与此同时，在绿脓杆菌功效下有机化合物被再度溶解与消化吸收，废水就净化处理变成比较整洁的水。运用人工湿地完成畜禽养殖废水的解决，不但资金投入低成本，并且可取得比较好的洁净实际效果，有着无法估量的应用前景。